蛋白定量
蛋白定量即蛋白質定量,蛋白質定量根據(jù)其目的分為蛋白質的“總定量”和特定蛋白質的“個別定量”。蛋白定量是生物學實驗不可缺少的一部分,為驗證細胞裂解是否成功,或為了將多個樣品進行平行實驗比較或標準化保存,需對細胞裂解液進行蛋白定量;為了判定蛋白的產(chǎn)量,需對純化好的蛋白進行定量;為了將純化好的蛋白用生物素或報告酶進行標記,同樣需要首先對蛋白樣品進行定量,以保證標記反應在適當?shù)幕瘜W濃度下進行。
蛋白質是一種十分重要的生物大分子,它種類繁多,結構不一,功能各異,分子量相差很大,因此建立一個理想而又通用的蛋白質定量分析方法很因難。
現(xiàn)測定蛋白質含量的方法有很多:根據(jù)物理性質來分有紫外分光光度法;根據(jù)化學性質來分有凱氏定氮法、雙縮脲法、Folin-酚試劑法(Lowary法)、BCA法和膠體金法;根據(jù)染色性質有考馬斯亮藍染色法、銀染法;根據(jù)其他性質有熒光法;其中較為常見的有以下五種。
1
蛋白質分子中含有共軛雙鍵的酪氨酸、色氨酸等芳香族氨基酸具有吸收紫外光的性質,其吸收高峰在280 nm波長處,且在此波長內吸收峰的光密度值與蛋白濃度成正比,故可作為蛋白質定量測定的依據(jù)。該方法是最快的蛋白質定量方法,但由于各種蛋白質中酪氨酸和色氨酸含量不同,如要準確定量則應有待測蛋白質的純品作為標準來比較,或者知道其消光系數(shù)作為參考。另外,不少雜質在280 nm波長下也有—定吸收能力,可能發(fā)生干擾,其中核酸(嘌呤和嘧啶)的影響尤為嚴重。核酸的最大吸收峰是在260 nm,因此若溶液中存在核酸,必須同時測定OD260與OD280,然后根據(jù)兩種波長的吸收度比值,通過經(jīng)驗公式校正,以消除核酸的影響而推算出蛋白質的真實含量。
優(yōu)點操作簡便迅速,且不消耗樣品(可以回收),多用于純化蛋白質的微量測定。
缺點(1)當待測的蛋白質與標準蛋白質中的酪氨酸和色氨酸含量差異較大時,會產(chǎn)生—定誤差。
(2)混有核酸時必須分別測定280 nm和260 nm兩處的OD值,再按公式推算蛋白質含量。
2
雙縮脲(NH3CONHCONH3)是兩個分子脲經(jīng)180℃左右加熱放出一個分子氨后得到的產(chǎn)物。在強堿性溶液中,雙縮脲與CuSO4形成紫色絡合物,稱為雙縮脲反應。凡具有兩個酰胺基或兩個直接連接的肽鍵,或能通過一個中間碳原子相連的肽鍵,這類化合物都有雙縮脲反應。紫色絡合物顏色的深淺與蛋白質濃度成正比,而與蛋白質分子量及氨基酸成分無關,故可用來測定蛋白質含量。測定范圍為1-10 mg蛋白質。干擾這一測定的物質主要有硫酸銨、Tris緩沖液和某些氨基酸等。
優(yōu)點較快速 ,不同的蛋白質產(chǎn)生顏色的深淺相近,以及干擾物質少。
缺點靈敏度差,常用于需要快速但并不需要十分精確的蛋白質測定。3
考馬斯亮蘭結合法是近年來發(fā)展起來的蛋白質定量測定法??捡R斯亮蘭能與蛋白質的疏水區(qū)相結合,這種結合具有高敏感性,考馬斯亮蘭G250 的最大光吸收峰在465 nm,當它與蛋白質結合形成復合物時,其最大吸收峰變?yōu)?95 nm。在一定范圍內,考馬斯亮蘭G250-蛋白質復合物呈青色。在595 nm下,光密度與蛋白質含量呈線性關系。故可以用于蛋白質含量的測定。
優(yōu)點(1)操作簡便、快速;檢測靈敏;重復性好。
(2)顯色迅速,約2分鐘內可完成染料與蛋白質的結合,所現(xiàn)顏色至少在1小時內是穩(wěn)定的。
(3)與改良Lowary法相比,干擾物質較少。
缺點(1)當樣品中存在較大量的SDS、TritonX-100等去垢劑時,顯色反應會受到干擾。如樣品緩沖液呈強堿性時也會影響顯色,故必須預先處理樣品。
(2)考馬斯亮蘭G250染液不宜久存,以1-2月為宜。
4
Lowary法是雙縮脲法和福林酚法的結合與發(fā)展,其原理是:蛋白質溶液用堿性銅溶液處理,形成銅-蛋白質的絡合鹽,在加入酚試劑后,除使肽鏈中酪氨酸、色氨酸和半胱氨酸等顯色外,還使雙縮脲法中肽鍵、堿性銅的顯色效果更強烈。因此,Lowary法的顯色效果比單獨使用酚試劑強烈3-15倍,為雙縮脲法的100倍。由于肽鍵顯色效果增強,從而減小了因蛋白質種類引起的偏差。
注意事項
(1)酚試劑只在酸性條件穩(wěn)定,故當其加到堿性的銅-蛋白質溶液中時,必須立即混勻,以便在磷鉬酸-磷鎢酸試劑被破壞前,還原反應即能發(fā)生。
(2)為了保證反應進行完全,反應在25~30℃水浴中進行,反應30 min后準時比色。
(3)避免還原物質干擾本實驗。
優(yōu)點微克級高靈敏度定量測定,穩(wěn)定。
缺點(1)受植物體內存在的酚類物質干擾。
(2)去污劑如TritonX-100,SDS,NP-40的濃度超過0.2%時會影響定量結果。
5
BCA蛋白定量法需要兩種試劑:
試劑A:稱取1 g sodium bicinchoninate,2 g Na2CO3,0.16 g酒石酸鈉,0.4 g NaOH和0.95 g NaHCO3,定容到100 ml,用NaOH將pH調到11.25。
試劑B:將0.4 g CuSO4?5H2O溶于10 ml水中。
工作液:100份試劑A和2份試劑B混合。
測量方法:取25 μl 標準品加入到200 μl BCA工作液中,37℃或60 ℃孵育30 min,檢測562 nm處的吸光度繪制標準曲線。用同樣的方法檢測蛋白樣品的吸光度可算出蛋白樣品的濃度。
(1)靈敏度高,檢測濃度下限達到25 μg/ml,最小檢測蛋白量達到0.5 μg,待測樣品體積為1-20 μl。
(2)操作簡單,快速,45分鐘內完成測定,比經(jīng)典的Lowary法快4倍且更加方便。
(3)測定蛋白濃度不受絕大部分樣品中的去污劑等化學物質的影響,可以兼容樣品中高達5%的SDS,5%的Triton X-100,5%的Tween 20,60,80。
(4)在20-200 μg/ml濃度范圍內有良好的線性關系。
(5)檢測不同蛋白質分子的變異系數(shù)遠小于考馬斯亮藍蛋白定量法。
(6)經(jīng)濟實用,除試管外,測定可在微板孔中進行,大大節(jié)約樣品和試劑用量。
缺點受螯合劑和略高濃度的還原劑(EDTA小于10 mM,DTT小于1 mM,巰基乙醇低于1mM)的影響。
以上是針對全蛋白質的“總定量法”,然而許多實驗需要對溶液中特定蛋白進行定量分析,即針對特定蛋白質的“個別定量”。針對特定蛋白定量常用的方法有酶聯(lián)免疫吸附試驗法(ELISA),免疫印跡分析法(WB)和質譜檢測(MS)。
1
ELISA
ELISA是溶液中特定蛋白定量的一種常用方法,通常是在96孔板上進行,關鍵步驟是特定抗原/蛋白的固定。具體來說,ELISA有不同變種。
直接或間接ELISA
特定抗原/蛋白直接吸附到檢測板,封閉未被抗原包被的孔板表面,然后在孔板中加入酶標(直接ELISA)或未酶標(間接ELISA)的第一抗體,在測試孔板中,一抗與抗原/蛋白相結合。對于未酶標的第一抗體,加入酶標的第二抗體與第一抗體結合。最后,加入酶底物(通常是四甲基聯(lián)苯胺TMB或堿性磷酸酶ALP)使溶液發(fā)生顏色變化然后使用分光光度計檢測。顏色變化與蛋白質濃度是直接相關的。
直接ELISA的優(yōu)點是速度快,并且沒有第二抗體的交叉反應問題,但局限是第一抗體的標記可能是費時和昂貴的。此外,信號放大是最弱的。因此,更常用的是
夾心ELISA
特定抗原/蛋白結合在孔板表面包被的第一抗體(捕獲抗體)和酶標的第二抗體(檢測抗體)之間,第二抗體比較容易買到,但可能會發(fā)生第二抗體的交叉反應。
任何ELISA測定蛋白質濃度的一個重要環(huán)節(jié)都是蛋白質標準曲線,通常是連續(xù)稀釋已知濃度的蛋白質,從而繪制標準曲線。
2
WB只能半定量。通過凝膠電泳把原始或變性的蛋白質分開,把蛋白質轉膜(硝酸纖維素或PVDF),然后使用特定的酶標抗體檢測。最后,加入適當?shù)牡孜铮ɑ瘜W發(fā)光底物)產(chǎn)生可檢測的信號。雖然WB比ELISA更費時,但是WB不僅可以對特定的蛋白進行定量,而且可以在實驗中同時檢測蛋白質修飾。
3
MS是蛋白質定量的新興方法。在蛋白質組學分析中,除了蛋白定性之外,一個重要的步驟就是對特定的蛋白進行定量分析。MS定量蛋白的方法有很多。
常用的方法是較重的穩(wěn)定同位素碳(13C)或氮(15N)加入到第一個樣本(多肽或蛋白質),而相應的輕同位素(12C和14N)加入到第二個樣本(內標),然后混合這兩個樣本進行分析。由于兩個樣本的質量差,用質譜分析儀測定的兩個樣本峰強度的比值就相當于其相對豐度比。
質譜蛋白定量的第二種方法,可以不用標記樣本,即用基質輔助激光解吸/電離 - MALDI分析。
使用質譜這種通用方法可以在一次實驗中同時進行定量和定性檢測。但這種方法需要的檢測儀器很昂貴,從而限制了該方法的使用。
總之,雖然測定蛋白質含量的方法很多,但還沒有一個完美的方法。在選擇測定方法時,可根據(jù)實驗要求和實驗室條件決定。