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如何利用借助重組蛋白探索轉甲狀腺素蛋白抑制β淀粉樣蛋白聚集機制

2024-07-03

阿爾茨海默?。ˋlzheimer’s disease,AD)俗稱(chēng)老年癡呆癥,是一種典型的神經(jīng)退行性疾病,主要病理特征是腦萎縮和腦細胞死亡。該病自1906年被首次報道以來(lái)已有百年之久,目前仍未完全明確其發(fā)病機制,針對各種發(fā)病機制假說(shuō)(如β淀粉樣蛋白級聯(lián)學(xué)說(shuō)、Tau蛋白異常磷酸化學(xué)說(shuō)、膽堿能學(xué)說(shuō)、神經(jīng)炎癥等)的藥物研發(fā)目前也僅有Aducanumab、Lecanemab被美國FDA批準上市。Aducanumab、Lecanemab是通過(guò)清除AD患者大腦內β淀粉樣斑塊而發(fā)揮作用的單克隆抗體藥物。研究表明,人體內轉甲狀腺素蛋白(transthyretin,TTR)對AD具有神經(jīng)保護作用,這種神經(jīng)保護作用能夠延緩AD的疾病進(jìn)程。

轉甲狀腺素蛋白(transthyretin,TTR)負責甲狀腺素和視黃醇在人體內的轉運工作。正常情況下,TTR是一種同源四聚體蛋白,其四聚體結構非常穩定。但當TTR四聚體解離成單體后,TTR單體會(huì )迅速發(fā)生錯誤折疊并聚集形成淀粉樣纖維,最終導致TTR淀粉樣變性,如淀粉樣心肌癥。盡管TTR的錯誤折疊與TTR淀粉樣變性密切相關(guān),但多項證據表明,TTRAD具有神經(jīng)保護作用。那么,TTRAβ二者作用的詳細機制如何?是否可為TTR神經(jīng)保護作用機制的抗AD藥物設計提供理論依據?

The initial structures for protein-protein docking

針對轉甲狀腺素蛋白(transthyretin,TTR)和Aβ蛋白的研究,首先需要高質(zhì)量的蛋白滿(mǎn)足研究需求。武漢佰樂(lè )博生物(Biolab Reagents)作為普健生物旗下控股子品牌,專(zhuān)注于引進(jìn)、整合全球業(yè)內高品質(zhì)蛋白、抗體產(chǎn)品。作為法國ProteoGenix、Antibodysystem品牌亞洲區獨家運營(yíng)代理商。提供近2萬(wàn)種以蛋白、抗體為核心的生命科學(xué)試劑,旨在為生命科學(xué)科研工作者提供專(zhuān)業(yè)、全面、可靠的試劑產(chǎn)品。這項研究中,佰樂(lè )博不但可提供研究所需的針對轉甲狀腺素蛋白(transthyretin,TTR)和Aβ蛋白,還可提供更多AD疾病相關(guān)的蛋白抗體試劑。


常見(jiàn)的形式有Aβ1-40Aβ1-42,但Aβ1-42在體內的聚集傾向及細胞毒性更強,通常使用Aβ1-42來(lái)作為研究對象。該結構是一個(gè)通過(guò)冷凍電鏡技術(shù)輔以固體NMR實(shí)驗獲得的近原子分辨率的纖維聚集體結構,結構中所有42個(gè)殘基的骨架和幾乎所有的側鏈在冷凍電鏡密度圖中都得到很好的解析。研究表明,較小的可溶性Aβ低聚體是Aβ細胞毒性的主要形式,因此在研究轉甲狀腺素蛋白(transthyretin,TTR)與Aβ蛋白機制時(shí),以五聚體作為Aβ低聚體的代表形態(tài)更具代表性。

為了獲得用于描述TTR/Aβ相互作用的復合物結構,進(jìn)行蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)的分子對接。為探究TTR不同結構形態(tài)對二者相互作用的影響,分別對TTR單體/Aβ單體、TTR四聚體/Aβ單體、TTR單體/Aβ五聚體及TTR四聚體/Aβ五聚體進(jìn)行了分子對接,各體系分別標記為AβTTRM、AβTTRT、AβOTTRMAβOTTRT。為了深入探究TTR的相互作用過(guò)程,進(jìn)一步對各體系進(jìn)行了分子動(dòng)力學(xué)模擬。

The protein-protein docking models for each system


結果表明,TTR四聚體及單體均能與單體作用,TTR四聚體的甲狀腺素結合通道是單體的主要結合部位。此外,TTR四聚體的EF螺旋、EF loop同樣能夠結合單體。當TTR四聚體解離后,TTR單體的內部片層疏水部位暴露,該部位對單體具有較強的親和力。TTR聚集體作用,由于TTR單體與聚集體均為富含β折疊的結構,使得二者能夠共聚集形成聚合度更高的聚集體,從而降低聚集體的細胞毒性。

The illustration of speculative interaction mechanisms between TTR and Aβ



這項研究表明,TTR結構的特殊性使得其對Aβ單體具有較強的相互作用能力,可通過(guò)“扣押”單體的形式抑制Aβ的聚集。這種結構特殊性表現為:a. 正常情況下TTR以穩定四聚體形式存在,其結構中的T4結合通道及視黃醇結合部位為Aβ提供了適當的結合空間,有利于A(yíng)β單體的結合;b. 四聚體解離產(chǎn)生TTR單體,導致疏水界面DAGH折疊片層的暴露,使得Aβ單體同樣能夠作用于該疏水界面(Aβ單體的疏水核心為17LVFFA21),達到“扣押”Aβ單體的作用。其次,TTR單體的結構特征與Aβ聚集體的結構相似,均為富含β折疊的結構,這使得TTR單體能夠與Aβ聚集體共聚形成聚合度更高的無(wú)毒聚集體,從而達到抑制Aβ細胞毒性的效果。整體而言,本工作在原子尺度上探究了TTR與Aβ相互作用的機制,并揭示了TTR神經(jīng)保護作用的分子機制,在一定程度上為基于TTR神經(jīng)保護作用機制的抗AD藥物研發(fā)提供了理論線(xiàn)索。


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